Kereta Api Malioboro Ekspres melayani kelas Ekonomi dan Eksekutif dengan awal rute start mulai Kota Yogyakarta finish Kota Malang dan sebaliknya Malang-Yogyakarta, dengan waktu berangkat jam 08:20 dari Kota Malang dan jam 07:45 dari Kota Yogyakarta. Untuk KA Malioboro Ekspres malam hari berangkat pukul 20:10 dari Malang dan Pukul 20:45 dari Yogyakarta.
Untuk Kereta Malioboro Ekspres 94 waktu tiba atau kedatangan jam 15:43 di Kota Malang dan KA 93 datang jam 15:35 di Yogyakarta, untuk KA 96 Malam hari tiba pukul 03:49 di Malang dan KA 95 datang jam 03:35 di Yogyakarta.
Kereta Api Malioboro Ekspres
1. Stasiun Yang Dilalui
Untuk KA Malioboro Ekspres 93 & 95 juga tetap akan melati rute stasiun yang sama, akan tetapi untuk waktu keberangkatan serta kedatangan berbeda-beda menurut jadwal dari tiap perjalanan Kereta Api tersebut.
2. Yogyakarta-Malang
Bagi Anda yang berdomisili khususnya di Provinsi Jawa Tengah dan sedang ingin berencana berlibur ke Malang Jawa Timur cocok sekali memilih KA Malioboro Ekspres, kereta api dari Jogja waktu tiba paling pagi di Malang yaitu jam 03:49 dini hari.Anda bisa memilih naik KA Malioboro Ekspres 96, dan tak perlu bingung dalam memilih Stasiun di Malang. Karena stasiun pemberhentian terakhir dari kereta Yogyakarta-Malang yaitu di St. Kota Baru yang biasa dituju wisatawan ketika ingin berlibur ke Kota Wisata Batu.
Di stasiun tersebut akan lebih mudah dalam mencari Transportasi lanjutan dengan tujuan Kota Batu, jajaran Kuliner Stasiun Malang, Hotel, Penginapan atau mungkin beberapa wisata bisa Anda kunjungi dengan jarak yang terbilang cukup dekat.